1、地理位置不同：
上海站位于上海市静安区秣陵路，毗邻上海长途客运总站，是上海铁路枢纽的重要组成部分。
上海南站位于上海市徐汇区沪闵路，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的客货特等站，是上海铁路客运南大门，是上海铁路枢纽1、地理位置不同：
上海站位于上海市静安区秣陵路，毗邻上海长途客运总站，是上海铁路枢纽的重要组成部分。
上海南站位于上海市徐汇区沪闵路，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的客货特等站，是上海铁路客运南大门，是上海铁路枢纽的重要组成部分。
2、主要线路不同：
上海站主要线路是京沪铁路、沪昆铁路、沪宁城际铁路。
上海南站主要线路是沪杭铁路、京沪铁路、金山铁路。
3、投用时间不同：
上海站投用日期是1908年。
上海南站投用日期是2006年7月1日。
上海站交通换乘
1、轨道交通
上海火车站轨道交通站台位于上海市静安区上海火车站南广场地底及北广场地面，为1、3、4号线站台。其中，1号线站厅位于南广场，铁路上海站东南出口设有通往1号线站厅的快速进站口，乘客在经过铁路出站闸机后无需再次安检，可直接购买地铁车票并进站。3号线、4号线车站位于铁路站场的东北侧，路轨平行于京沪铁路。在站厅西侧设有未编号的入口与上海站西北出口、上海长途客运总站连接；东侧设有一个未编号的出站通道。
2、长途汽车
上海长途汽车客运总站位于铁路上海站北广场西侧，于2005年11月投入使用。该站主要开行往皖南、皖北、苏北、浙东以及江阴、常熟等铁路不方便到达和上海周边地区。
3、主营线路
昆山、常熟、启东、吕四、湖州、张家港、南京、苏州、无锡、常州、杭州、嘉兴、南通、太仓、淮安、吴江、平望、宜兴、海门、六甲。
