第一大主要原因，大搞藩属国制度，致使政权分化。
跟西周的分封制很接近，类似今美国的联邦制度，属众星拱月。可时间一长，随着血缘的淡化与距离的存在，就日益分离。其中，威胁最大的则应是钦察汗国、察合台汗国、伊利汗国。
第二大主要原因，大搞人种歧视，即四等人制，致使汉蒙矛盾激化。分为蒙古、色目、汉人、南人四等。作为统治阶级的蒙古人最高贵，色目人次之，原南宋地区的南人最没地位，最受打压，获得最憋屈。这样为元末南方百姓起事埋下一大伏笔。
第三大原因，穷兵黩武，不注重休养生息。元朝的战争大约可分五个阶段：1206-1253年为灭西辽、西夏、金国、吐蕃、大理等国的阶段；1253-1279年为灭南宋的阶段；1280-1284年为镇压复宋起义的阶段；1285-1349年为对内镇压起义、对外侵略扩张的阶段；1351-1368则为元末农民起义阶段。
第四大原因，内政不稳。
统治集团内部争权夺利，政局不稳，皇帝大多不理国政，贪图享受，腐化至极。经臣勾心斗角，欺上瞒下，朝廷横征暴敛，经济越来越衰，激起广大人民的反抗。特别元朝中期频繁更换皇帝，仅在25年中( 1307年至1333年)就更换了36个皇帝，更加造成时局动荡不稳。
1388年，一支由10万人组成的中原军队进入蒙古地区，打败了元顺帝的孙子。至此，大多数蒙古部落宣布自治，蒙古草原又回归到历史上四分五裂的状态。一个以旋风般快速崛起的元朝帝国，一座巍然耸立的、庞大的帝国大厦，转眼之间就这样以同样旋风般的速度轰然倒塌，土崩瓦解，成为废墟。
