一、人工清理
鱼缸中看到绿藻，最简单的方法就是人工清理。将鱼捞出放到别的地方暂养，然后用刮藻刀或软布将附生在缸壁和缸底的藻清除掉。需要注意的是，这种方式虽然快，但治标不治本，如果不注意预防，很快又会长出来。
二、食藻生物
如果觉得定期清理藻类很麻烦，可以养一些食藻的生物，最常见的就是清洁鱼，比如清道夫、金苔鼠等。除此之外，一些螺和虾也有吃藻的习性，不过将它们和鱼类混养的话，还是有一定风险的。
三、药物除藻
药物除藻一般很少用于家庭养鱼，因为用药还是很难控制用量的，所以对鱼儿的健康有一定风险。常用的除藻剂有两种，一种是戊二醛，另一种是硫酸铜，这两种都有不错的效果，但不能混用，否则会导致失效。
四、日常预防
想要避免藻类爆发，一定要从源头上治理。克制藻类繁殖的方法有两种，一种是加强过滤，这样可以减少水中有机物的含量，当然，也可以通过减少投喂的方式达到同样的目的。另一种是适当遮阴，藻类爆发离不开光照，因此遮阴也能限制其生长。
物理清除法： 简单的说就是拿刷子去刷，市面上卖的磁铁刷，鱼缸刷都很好用，同时并用换水，效果极佳。缺点是麻烦，角落等地方不易清除，而且常常会搞的整缸鸡飞狗跳，缸子一多更是大工程。
化学清除法： 使用除藻剂，效果普通，优点是对任何藻类都有效，且可有效清除附著在水草、沉木等不易清除地方的藻类。缺点是依据品质不同对鱼和生态平衡有一定程度的冲击。
生物清除法〔最佳方式〕： 使用除藻动物来控制藻类的数量，效果为三种中所花费时间较长，但最安全也最省力的方式。
