清除缓存时不能清除微信的原因可能有以下几点：
1. 权限问题：微信是一款拥有较高权限的应用，它可能认为自己的缓存数据对用户非常重要，因此不会允许其他应用或系统功能轻易删除它的缓存。
2. 缓存机制：微信的缓存机制可能与其他应用不同，它可能将缓存数据存储在系统无法直接访问的位置，从而导致清除缓存功能无法触及微信缓存。
3. 系统保护：部分操作系统为了保护用户数据的安全，可能会对一些重要应用如微信进行保护，防止其他应用或功能误删其数据。
4. 软件问题：可能是微信本身存在一定的问题，导致清除缓存功能无法正常作用于微信。
如果微信的缓存数据占据了较大的存储空间，影响了设备的正常运行，可以尝试以下方法进行解决：
1. 重新安装微信：卸载微信后，重新安装最新版本，这样可能会清除部分旧的缓存数据。
2. 使用微信修复工具：进入微信设置，点击帮助与反馈，选择修复图标，点击右上角的修复图标，选择修复聊天记录，尝试修复微信异常造成的聊天记录丢失。
3. 备份数据后升级系统：将微信数据备份后，尝试升级手机操作系统，然后再重新安装微信。这样可以避免升级系统时丢失微信缓存数据。
4. 使用第三方数据恢复软件：如果以上方法都无法解决问题，可以尝试使用第三方数据恢复软件扫描设备中的残余数据，并将已删除的微信聊天记录恢复。需要注意的是，选择正规的数据恢复软件，以免引起其他安全问题。
可以在手机上下载安装360手机卫士，打开之后进入工具箱，找到“微信清理”这个工具进行清理。
