黄河：我国第二条大河,流经伊克昭盟的西、北、东界,长约840多公里。从鄂托克旗巴音陶亥乡都斯图河口起,沿杭锦、达拉特、准格尔三旗边缘,到准格尔旗马栅乡小站止,呈似弓形,可谓“九曲黄河”之大曲。
乌兰木伦河：处伊金霍洛旗东北部。乌兰木伦系蒙古语,意为红河,以水中带有红色泥土得名。
扎萨克河：位于新街境内。扎萨克系蒙古语,以处原扎萨克旗境取名。
阿日图河：在红庆河乡南境。阿日勒图系蒙古语,意为倒斜坡,以发源于阿日勒图取名,西段叫通格朗河。
无定河：系黄河中游支流,蒙古语称萨拉乌素高勒(黄水河)。源出陕西省白于山北侧,向北绕经乌审旗南端,再折东南穿越长城经级德县,到清润县河口入黄河。全长375公里。自滴哨沟湾入乌审旗,流穿河南乡北沿、纳林河乡中南
纳林河：为无定河支流。在乌审旗西南部。源自陶利苏木陶利滩,向东南流经纳林河乡于谷家畔注入无定河。全长65公里,宽2-6米,一般水深0.5米-1米。属常年流水河。纳林系蒙古语,意为细长。因河床细窄,故名。在陶利苏木境一段亦称陶利河。
海流图河：系无定河支流。在乌审旗南部,发源于陶利苏木乡和巴音柴达木乡交界处的沙滩向东南流至横山县雷龙湾汇入元定河。
沙日摩仁河：简称摩林河。蒙古语意为黄河。
都斯图河：位于鄂托克旗西部。源于包日浩晓苏木乌兰图克嘎查海流图滩,流经包日晓浩、查布、巴音陶亥等乡苏木,在查布苏木跃进滩与后都斯图河汇合后注入黄河。
中国的第二大河——黄河，由宁夏石咀山附近进入内蒙古，由南向北，围绕鄂尔多斯高原，形成一个马蹄形。其中流域面积在1000㎞²以上的河流有107条；流域面积大于300㎞²的有258条。有近千个大小湖泊，主要有呼伦湖、贝尔湖、达里诺尔湖、乌梁素海、岱海、居延海等
