1、当事人可以到当地人力资源和社会保障局劳动监察投诉；
2、当事人可以到当地人力资源和社会保障局劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付运费。当事人向仲裁委员会提交劳动仲裁申请书，经审查，仲裁委员会收到劳动仲裁申请书之日起五日内作出受理或者不予受理的决定。决定不予受理的，应自作出决定之日起五日内制作不予受理通知书，送达申请人；决定立案的，应自作出决定之日起，五日内向申请人和被申请人发出书面通知。
3、当事人有欠条的，可以直接起诉到法院，要求支付欠条里的数额。该纠纷属于民事纠纷，当事人如果要提起诉讼，需要注意原告要与本案有直接利害关系，要有明确的被告，要有具体的诉讼请求及事实和理由等。运费若超过约定付款时间，则构成违约，可起诉追偿。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第三十条
用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
第八十五条
用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：
（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；
（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
（三）安排加班不支付加班费的；
（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。
