（1）性质不同。撤职是处分的一种，即撤销现任职务；而免职是干部管理与免职的一种方式，是工作人员的职务变迁和调整，不是处分。
（2）适用条件不同。撤职适用于严重违反行政纪律，造成国家和人民利益重大损失，已不能担任现任职务的行政机关公务员；而免职则是依据《中华人民共和国公务员法》第四十条的规定，根据试用期满考核合格、职务发生变化、不再担任公职以及其他情形需要任免职务的，应当按照管理权限的程序任免其职务。
（3）法律后果不同。受撤职处分的，不仅应当撤销其现任职务，而且应当按照规定降低其职务、级别。而免职的，按照身体、年龄和德、能、勤、绩等情况，有的不再安排工作，有的安排平级或者较低职务，有的晋升职务。但晋升职务的以及一些特殊情况外，一般原职级待遇不变。（4）决定机关不同。撤职是根据受处分的错误事实由任免机关或者监察机关作出处分决定；而免职一般由有关部门提出免职报告或者本人申请，由任免机关下达免职令或者通知。
两者的区别就在于它们有本质上的不一样。撤职：是对一个人的职务上的撤销，把乌纱帽打掉的做法，这是对人的一种很严重的处分； 免职：是免去一个人的一种职务的做法，但是免职并不是代表对人的一种处分，例如：免去某某人的某某职务，另有重任。
