两者的区别主要在于品种和生长环境。
1. 大闸蟹是江苏、上海和浙江等地的一种蟹类，花蟹则是广东、福建等南方地区的一种蟹类。
品种受到了不同的环境、气候等因素的影响，因此呈现出不同的特点。
2. 此外，两者生长环境和生长习性也不同。
大闸蟹喜欢生活在江河湖泊等淡水环境，花蟹则喜欢生活在咸水环境，两者的生长环境和食物来源也存在差异。
综上所述，大闸蟹和花蟹在品种和生长环境方面存在差异。
主要区别是，科目分类不同、形态特征不同、生境分布不同，具体如下：
一、科目分类不同
1、大闸蟹
大闸蟹是河蟹的一种，河蟹学名中华绒螯蟹。属十足目、方蟹科、绒螯蟹属、中华绒螯蟹种。
2、花蟹
花蟹因外壳有花纹而得名。花蟹有时专指兰花蟹（远海梭子蟹的雄性个体），属十足目、梭子蟹科、梭子蟹属、远海梭子蟹种。
二、形态特征不同
1、大闸蟹
体型较大，头胸甲呈圆方形，边缘有细颗粒前半部窄于后半部，背面较隆起，前面有6枚突起，前后排列，前者2枚较大后者4枚小，居中间2枚较小而不明显，各个突起均有细颗粒，额分为4齿，齿缘有锐颗粒，眼窝缘近中部的颗粒较锐，螯足粗壮，长节背缘近末端有一齿突，内、外缘均有小齿腕节内缘末半部具1颗粒隆线向后伸至背面基部，内末角具一锐刺，刺后又有颗粒。雄性掌、指节基半部的内、外面均密具绒毛，而雌性的绒毛仅着生于外侧，内侧无毛。
2、花蟹
头胸甲宽约为长的2倍，梭形 ，表面具粗糙的颗粒，雌性的颗粒较雄性显著，螯脚左右大小不同，瘦长，雄性螯脚长度约等于头胸甲长的4倍，表面具花纹。雌雄体色有明显差异。雄性除在螯脚之可动指与不可动指及各步脚的掌节（前节）、指节（末节）为深蓝色外，其余部位大都呈蓝绿色并布有浅蓝或白色斑驳。雌性头胸甲前部为深绿色，后部布有黄棕色斑驳；螫脚前节腹面淡橙色、延伸至可动指及不可动指基部，二指前端为深红色，步脚前节和指节淡橙色。
三、生境分布不同
1、大闸蟹
中华绒螯蟹在中国分布很广，通海的江河基本都有分布，北自辽宁，南至福建沿海诸省通海河流中均有分布，尤其是长江中下游两岸湖泊、江河中都有它的踪迹。中华绒螯蟹的栖居，因生态条件而有所不同，可分为隐居和穴居两种。在饵料丰足的情况，中华绒螯蟹为躲避敌害而掘洞过穴居生活，但当中华绒螯蟹生活的水域不适于中华绒螯蟹造洞穴居时，它就寻找石砾或者水草丛中隐居。尤其是水质清新，水草丰盛的江河、湖泊、沟渠等水域。
2、花蟹
花蟹为暖水性蟹类，在我国主要分布于浙江、 福建、 台湾、 广东、 广西及海南岛等沿海。栖息于水深10至30米的砂泥或岩礁底质的海底。
