孔府共有厅、堂、楼、房463间。九进庭院，三路布局：东路即东学，建一贯堂、慕恩堂、孔氏家庙及作坊等；西路即西学，有红萼轩、忠恕堂、安怀堂及花厅等；孔府的主体部分在中路，前为官衙，有三堂六厅，后为内宅，有前上房、前后堂楼、配楼、后六间等，最后为花园。孔府仿照封建王朝的六部而设六厅，在二门以内两侧，分别为管勾厅、百户厅、典籍厅、司乐厅、知印厅、掌书厅、公共管理孔府事务。
走进孔府大门、穿过小院，便到了孔府二门。此门为清代建筑，是按照清定制所建。门进深2间，面阔3间，高8.33米，长13.27米，宽9.37米。五檩三柱分心式木架，灰瓦悬山顶，檐下施一斗二升交麻叶斗拱，平身科二攒。当中间辟门，两侧间用实墙，上悬挂长沙李东阳书写的“圣人之门”竖匾(此匾应为原大门之匾)。李东阳，字宾之，号西涯，湖南人，17岁中进士，官至吏部尚书，华盖殿大学士，国史总裁，明朝著名诗人。他多才多艺，尤其是在建筑设计上有很多的天赋，明弘治年间孔府、孔庙的不少房屋布局都出自他的设计之手。孔府扩建之前，他把女儿嫁给了孔子六十二代孙衍圣公孔闻韶为一品夫人。有了这种特殊的姻亲关系，自然会全力效劳。二门的左右两边各有一个掖门，是平时公府役员出入的通道。
◆重光门
进入二门，一座孤零零的门楼坐落在路的中间，遮住了游人的视线，这就是“重光门”,旧时称之为“垂珠门”。此门始建于明弘治十六年(1503年）高5.95米，长6.24米，宽2.03米，四柱三间三楼垂以莲花，明间略高，檐下施一斗二升云拱，明间平身科二攒，次间一攒，梁架结构，前后各有4个倒垂的木雕莲蕾。莲花，是清廉、纯洁的象征，在此寓意衍圣公府高尚廉洁，清白无瑕。
