牡丹鹦鹉的公母可以通过观察头型、体型、尾羽尖和泄殖腔来区分。公鸟头型为背儿头、头尖，体型较瘦、毛紧、好动、性凶，眼圈距头顶距离较远，眼显小。
母鸟头型为扁平圆滑、头纯圆，体型较胖、毛稍松，不太好动，眼圈距头顶距离较近，眼显大。同时公鸟的尾羽尖较尖，为V型；母的尾羽尖分叉则为W型。
另外，雄鸟的泄殖腔表现耻骨间间距小、并表现有兴状突起；雌鸟的泄殖腔为两耻骨之间间距大，尤其成鸟一中指可以伸进，并且扁平，无突起状。经验丰富者从小鸟即可无误的进行辨别雄雌。
区分牡丹鹦鹉的性别是一个需要细心和经验的过程。以下是一些方法：
观察头型：雄鸟的头型通常比雌鸟更尖，更小。而雌鸟的头型更扁平，更大。
观察体形：雄鸟通常比雌鸟更瘦，毛更紧，好动且性格凶猛。雌鸟则更胖，毛稍松，不太好动。
观察卧杠姿态：雄鸟在杠上通常是立势，昂首挺立，显得矫健。而雌鸟在杠上是伏卧式，扒在杠上，温顺。
观察尾羽尖：雄鸟的尾羽尖为尖型，而雌鸟的尾羽尖分叉为W型。
触摸泄殖腔：雄鸟的泄殖腔耻骨间距较小，并有突起（即尖状物）。而雌鸟的泄殖腔耻骨间距较大，没有突起。
请注意，这些方法需要经验丰富的观察者才能准确区分。如果你是初学者，建议你请教有经验的养鸟者或专家。
