蛋白质数据库包括哪四种(蛋白质数据库官网入口)

蛋白质数据库包括哪四种(蛋白质数据库官网入口)

首页维修大全综合更新时间:2025-11-22 18:18:40

蛋白质数据库包括哪四种

UniProtKB、PDB、Pfam和CATH。

1. **UniProtKB (Universal Protein Resource)**:是一个综合性的蛋白质数据库,提供了广泛的蛋白质序列和注释信息。它由几个子数据库组成,包括Swiss-Prot(手工注释的蛋白质数据)、TrEMBL(自动注释的蛋白质数据)和PIR-PSD(蛋白质互作关系数据库)。

2. **PDB (Protein Data Bank)**:是一个收录蛋白质结构的数据库,提供通过X射线晶体学、核磁共振、电子显微镜等实验方法确定的蛋白质三维结构信息。

3. **Pfam**:是一个蛋白质家族数据库,它通过对蛋白质序列进行比对和分析,将具有相同祖先的蛋白质归类到同一个家族中,并提供这些家族的详细信息。

4. **CATH**:是一个基于层次分类的蛋白质结构分类数据库,它根据蛋白质的结构相似性和进化关系将蛋白质分为不同的类别。

除了上述四个数据库,还有其他如SCOP2、KEGG、OMIM等也是非常重要的蛋白质数据库,它们各自提供不同方面的蛋白质信息,如功能分类、代谢途径和遗传疾病相关信息等。这些数据库对于生物医学研究人员来说是非常宝贵的资源,可以帮助他们更好地理解蛋白质的功能、结构和相互作用,从而推动生命科学的发展。

PIR:蛋白质信息资源SWISS-PROT:蛋白质序列和注解PDB:国家实验室蛋白质数据库MMDB:蛋白质分子模型数据库

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