地点不同。
泉州少林寺，又名镇国东禅寺，俗称南少林，位于泉州清源山东麓，相传为曾救唐王十三棍僧之一的智空入闽所建。
莆田南少林在：莆田市福建省莆田市荔城区西天尾镇九莲山林山村,距市区约17公里。
莆田少林寺和泉州少林寺都是中国南方的佛教寺庙，且都与武术文化有着密切的联系。然而，它们在历史、地理、文化、建筑等方面存在一些区别。
1. 历史地位：泉州少林寺位于福建省泉州市清源山东麓，创建于唐朝，由十三棍僧之一的智空禅师创建。而莆田少林寺位于福建省莆田市，其历史可以追溯到南宋，与泉州少林寺同为南少林寺的重要分支。
2. 武术文化：两座寺庙都与中国武术文化有着深厚的联系，但泉州少林寺在海内外具有更大的影响力，主要是因为其走出过洪拳创始人洪熙官，并通过洪熙官培养了一大批武术传人，如黄飞鸿等。
3. 地理环境：泉州少林寺位于泉州市城郊结合部的清源山之东岳山麓，交通便捷。而莆田少林寺则位于莆田市，其旧址上出现的文字记录，以及寺庙所处位置的地形优势，使得这里被视为南方少林寺的旧址。
4. 文化氛围：莆田少林寺被认为是正统的南少林寺，很大的原因是因为发现的旧址上出现的文字记录，以及寺庙所处位置的地形优势和南少林习武之风的高度吻合。而泉州少林寺则更有千年古刹的底蕴，符合泉州这座老城的历史人文气息。
总的来说，虽然两座寺庙在历史、地理、文化、建筑等方面存在一些区别，但它们都是南少林文化的重要组成部分，对于研究南少林文化具有重要意义。
