2017年01月08日,甘肃“两会”期间,甘肃政协委员、中国经济地理专业委员会副主任石培基建议,将祁连山国家级自然保护区及周边的自然保护区进行资源整合,申报成为国家公园。
2017年9月,中共中央办公厅国务院办公厅印发了《祁连山国家公园体制试点方案》,确定祁连山国家公园总面积5.02万平方公里。
2018年10月29日,祁连山国家公园管理局在甘肃省兰州市揭牌,西部生态安全的重要屏障祁连山至此实现生态跨区域统一保护管理。作为我国首批设立的10个国家公园体制试点之一。
2019年10月17日,祁连山国家公园标识正式揭幕并启用。