se是java标准开发工具包，主要用于开发桌面应用；
ee是企业版开发工具包，即除了包含se的内容，还包含了web开发需要的一些基础包，例如selvlet等。
区别如下：
1、Java SE:
Java SE 是Java平台标准版的简称（Java Platform, Standard Edition） (also known as Java 2 Platform) ，用于开发和部署桌面、服务器以及嵌入设备和实时环境中的Java应用程序。Java SE包括用于开发Java Web服务的类库，同时，Java SE为Java EE提供了基础。
Java SE（Java Platform, Standard Edition，Java标准版）就是基于JDK和JRE的。
2、Java EE:
Java EE是一种利用Java2平台来简化企业解决方案的开发、部署和管理相关的复杂问题的体系结构。J2EE技术的基础就是核心Java平台或Java SE，Java EE不仅巩固了标准版中的许多优点，例如“编写一次、随处运行”的特性、方便存取数据库的JDBC API、CORBA技术以及能够在Internet应用中保护数据的安全模式等等，同时还提供了对 EJB（EnterpriseJavaBeans）、Java Servlets API、JSP（Java Server Pages）以及XML技术的全面支持。其最终目的就是成为一个能够使企业开发者大幅缩短投放市场时间的体系结构。
