如果自己烧的开水等凉了以后再装入矿泉水瓶子会有毒么

当然有问题，最好不要那样。因为塑料都是石油化工产品 ，遇热尤其是较高温度就会析出有毒成分。矿泉水塑料瓶不是专门设计来装热水用的，不耐高温。塑料瓶都烫变形了，说明温度比较高，很可能已经导致瓶子产生一些化学变化了。所以最好不要用矿泉水瓶子盛开水喝。