云南鱼种类丰富，特有种类多，被誉为“淡水鱼类物种基因库”。全省有鱼类629种，其中土著鱼类有594种，占我国淡水鱼类种数的39.93%，居全国之首。现对部分鱼类种质资源作简要介绍，以供读者参考。
1.滇池金线鲃。鲤科鲃亚科金线鲃属，头背部及侧线上下有不规则的黑色斑块，俗称金线鱼、波罗鱼，是云南“六大名鱼”之一，分布于滇池流域。属于国家二级保护水生动物，极度濒危种。2007年人工繁殖成功，自2009年以来，共向滇池流域投放鱼苗350万余尾，在滇池入湖支流盘龙江形成一个稳定种群。
2.软鳍新光唇鱼。鲤科鲃亚科新光唇鱼属，俗称豹子鱼、花鱼，属杂食性鱼类，具有较高的观赏及经济价值，观赏鱼市场称黄金吉罗，主要分布于元江、李仙江。近年来，野生种群数量下降明显。2009年人工繁殖成功，可年产鱼苗种近千万尾，近4年内共向红河流域投放鱼苗20万余尾。
3.鱇浪白鱼。鲤科鲌亚科白鱼属，体细圆呈银白色，背部较暗，鳍为灰白色，俗称抗浪鱼，是云南“六大名鱼”之一，分布于抚仙湖。喜栖息于水质新鲜、含氧量较高的水域环境，为中上层鱼类，活动于开阔水面。20世纪90年代经人工驯养繁殖，成功挽救了该濒危物种。截至目前，共增殖放流鱼苗1000万余尾。
4.云南光唇鱼。鲤科鲃亚科光唇鱼属，体长、侧扁，背缘轮廓弧度大于腹缘，俗称马鱼。分布于金沙江、南盘江及附属湖泊。为中下层定居性鱼类，在江河湖泊中均能生活，喜居清水环境。食性杂，以丝状藻为主，水草次之，兼食动物性饵料。2013年实现规模化人工繁殖，2017年起累计开展增殖放流鱼苗80万尾。
5.暗色唇鲮。鲤科野鲮亚科唇鲮属，体较细长、少侧扁、肥厚，头楔形，吻圆钝向前突出，俗称猪嘴鱼。主要分布于南盘江、元江及李仙江。喜栖息于山区江河支流，生活于岩洞水底，啃食岩石上的青苔、藻类、植物碎屑、泥中腐殖质等。2011年人工繁殖成功，已向元江、南盘江等水域增殖放流鱼苗20万余尾。
6.昆明裂腹鱼。鲤科裂腹鱼亚科裂腹鱼属，体延长、稍侧扁，背腹缘均隆起，腹部圆，吻钝圆，口下位，身体背面及侧面被细鳞，背呈蓝灰色，腹面银白色，属于冷水性底层刮食性鱼类，主要分布于金沙江、乌江。2012年人工繁殖成功，截至目前，已向金沙江等水域增殖放流鱼苗20万余尾。
