《盗墓笔记》有八部。
第一部：《七星鲁王宫》
《七星鲁王宫》讲的是吴邪的第一次下地，在七星鲁王宫中经历了一系列的危险。这个故事中，靠着闷油瓶的力挽狂澜，吴邪他们最终逃出生天，整个故事开始极端的扑朔迷离。
第二部：《怒海沉沙》
《怒海沉沙》讲的是从机关重重的七星鲁王宫脱身之後，主角一群人随即被卷入一桩盗墓阴谋，经历了惊险万分的海底盗墓之旅。
第三部：《秦岭神树》
《秦岭神树》讲的是从西礁海底墓归来、在家赋闲没有几日的吴邪听到一个惊人消息后，又开始折腾，和老痒二人孤身深入到神秘莫测的秦岭探险。
第四部：《云顶天宫》
《云顶天宫》这次探险是最艰难的探险，也是吴邪最痛苦的一篇。各路人马带着各自的谜团走上死亡之路，漫天的白雪，狭窄雪域中的痛苦跋涉。 第五部上：《蛇沼鬼城》
《蛇沼鬼城》讲的是从云顶天宫顺利脱出之后，吴邪和苏醒后的三叔进行了一次长谈。吴邪了解到在二十年前海底古墓里发生的三叔没有透露的隐情。在快要接近真相的时候，两盘来自张起灵的录像带，又让事情重新进入了重重迷雾之中。
第五部下：《谜海归巢》
《谜海归巢》讲述的是深入西王母的蛇沼鬼城之后，吴邪一行经过三天三夜极其紧张的搜索，终于在隐藏于密林中的神庙附近找到了进入西王母宫的入口，继续进入西王母城探险的故事。
第六部：《阴山古楼》
《阴山古楼》讲述的是吴邪和胖子为了帮助闷油瓶找回记忆，深入十万大山的腹地，再进险境，搜集西沙事件残存的蛛丝马迹。
第七部：《邛笼石影》
《邛笼石影》讲述了吴邪一行人在拍卖会上认识霍老太太，引出一段盗墓的故事，这次盗墓是以前的延续，遇到了可怕的东西。之后又是等待，等待“它”的出现，并且一直在重复这个“它”有多可怕和重要。是疑团将要揭开的一部。
第八部：《大结局》
《大结局》讲述的是吴邪和胖子为了拯救闷油瓶，终于进入了张家古楼，关于三十年前的那支考古队，一切未解之谜，在这一部中都可以得到解释
