名侦探柯南中,柯南跟灰原哀相遇是在第129集
柯南的班级转来了灰原哀。
然后少年侦探团接到委托寻找一个男孩的哥哥,最后发现他哥哥被绑架制作伪钞,最后关头灰原哀拿起女主犯的枪射击,引起警察的注意,解救了小男孩的哥哥
灰原哀被警察责骂后装哭,柯南负责把她送回家,路上灰原哀向柯南说出自己是灰衣组织的人,并且是APTX4869的制作者。
灰原哀想起自己曾经把APTX4869的资料光盘连同姐姐的照片光盘送到一个大学教授家,然后他们去那个教授家,发现教授死了……
灰原哀知道自己的姐姐就死在柯南的面前,在柯南面前大哭……