在养殖过程中要有计划地进行定期消毒。
(1)水池消毒:在蝌蚪放养前要进行全池消毒，目的是杀灭池水和淤泥中的有害生物，改良水体和池底的生态结构。
①干池消毒:消毒前将池水抽干，然后在水池内挖几个小坑，将生石灰或漂白粉倒入坑内加水溶解，趁热将其均匀地泼洒到池底和四壁。一般每平方米水池用生石灰100克左右，如果用漂白粉，每平方米水池用12克左右。
②带水无动物消毒: 将生石灰或漂白粉溶解后，立刻进行全池均匀泼洒。一般每立方水体用漂白粉30克左右，或每立方米水体用生石灰250克左右。无论是带水消毒还是干池消毒，用生石灰消毒的水池一定要在消毒后经过7天才可以使用，用漂白粉消毒的水池一定要在消毒后经过3天才可以使用，严禁提前使用。使用前最好先放少量蝌蚪或蛙实验，在绝对安全的情况下方可全面使用。
③带水带动物消毒：有时对蝌蚪养殖池中的水进行消毒时无法将蝌蚪分离，必须连蝌蚪带水一起消毒，此时要严格控制用药浓度，谨防蝌蚪药物中毒。用这种方法消毒，漂白粉的用量一般为使水体浓度为0.5×10-6。最好在用药以前进行小实验，以确保用药剂量安全，无毒副作用。因此养殖户一定要准备一只小天平秤，严格地按用药的剂量来称量，千万不能马虎、粗心。
（2）幼蛙养殖区消毒：在幼蛙进入养殖场地以前，要进行全面、彻底消毒，可以撒生石灰或漂白粉，但是撒完生石灰或漂白粉以后要过1周才可以把蛙放入养殖场地。每天要按时喷水，使养殖场地保持一定的湿度，所以幼蛙养殖区消毒可以通过定期在日常喷淋的水里加消毒剂来完成。一般可以用高锰酸钾或漂白粉溶液喷洒整个养殖区。
(3)饵料消毒:
俗语说"病从口入"。幼蛙或蝌蚪食用了带有病原体的饵料往往会诱发发病，同时也会将病原体带入养殖区，成为新的传染源。即使暂时不发病，一旦时机成熟，病原菌就会大量繁殖，诱发疾病。因此在给蝌蚪喂食时，尽量选新鲜的饵料，并且煮熟了以后再喂，动物性饵料更应如此。由于幼蛙必须摄食能够活动的活饵料，因此投喂前要在浓度为5×10-6高锰酸钾溶液中浸泡2分钟，用清水洗干净后再喂。
(4)体表消毒:体表消毒是指将蛙或蝌蚪浸浴在药水中进行消毒，以杀灭体表的病原体。体表消毒并非针对有病个体，即使健康的个体也要定期进行消毒。特别是刚引进的蝌蚪或种蛙，在投放到养殖场地之前必须进行消毒处理，目的是防止将其他养殖场的病原体带进来。方法是将蝌蚪或蛙放到网箱内，再将网箱放到盛有药水的大缸或水泥池内浸浴。消毒要有针对性，不同的病原体用不同的药物，一般食盐和高锰酸钾用的比较多。食盐对寄生虫和细菌杀灭效果较好，使用浓度为2%～3%，浸浴时间为5～10分钟；高锰酸钾对细菌、霉菌的杀灭效果较好，使用浓度为10×10-6，浸浴时间为5～10分钟。
(5)器具消毒:养殖场地使用的所有工具，包括养殖饵料所用的工具都要进行严格的消毒
