对于地势比较低洼，排水不畅的玉米田，还是应该提前挖好排水沟渠比较好，省得到时手忙脚乱费事费力，还影响玉米生长。总之，尽量不要让玉米苗长时间的泡在水里。
等雨后地里的墒散失一些后，人能进地的时候，就要及时进行中耕松土。人常说锄头带水也带火，这时通过人工划锄，就可以散墒、破除土壤板结，提高土壤的通透性，有利于玉米根系的正常生长。同时通过划锄，也能够锄掉玉米田间的杂草，比噴施除草剂要好。当然如果田间杂草比较多的话，也可以在划锄的基础上噴施除草剂。
如果玉米叶片发黄不长，可以根据土壤施肥情况，采取沟施的方法追施速效氮肥，比如碳酸氢铵或者尿素等来补充养分，促使玉米苗正常生长，如果发现玉米苗势比较弱的话，也可叶面喷施芸苔素促进玉米根系的生长，同时也可喷施磷酸二氢钾加尿素溶液等叶面肥。
被水淹过的玉米苗，也容易大量发生病虫害，这时玉米苗自身的抵抗性相对比较弱，也给病虫害侵袭创造了便利的条件，往往还会有加重的趋势。所以要注意观察，及时针对具体的病虫害，喷施相对应的杀虫剂或杀菌剂进行防治。
综上所述，玉米苗期被水淹后会造成很大的危害，应该根据具体情况，采取措施及时进行补救，比如排水、中耕锄草、松土、补充养分、防治病虫害等。
