猪肉上不同颜色的盖章，只是因为各个地区对印章颜色的要求不一样。具体原因如下：
1、国家标准只是规定了印章颜料必须满足可食用的要求，并没有对颜色的使用做出规范。实际上，各地使用的颜色也不只是红色和蓝色这两种，有些地方还会使用紫色甚至绿色。
2、猪肉上无论是什么颜色的盖章，只要是出厂的猪肉，一定是“检疫合格”和“品质检验合格”的。如果有其中之一不合格，根本就不允许出厂销售。如果不合格的猪肉出了厂，不仅屠宰场要被处罚，销售或者使用这些不合格猪肉的餐饮服务经营者也要被处罚。
注意事项：
猪肉上的印章很难洗掉，大家也会担心会不会有害。其实，那是食品检验章专用的颜料，是用食品色素混合酒精、甘油、维生素C与水混合而成的，每一种原料都可以食用，不会危害健康。
拓展资料：
《生猪屠宰检疫规程》详细规定了生猪从进入屠宰场之后需要进行的各种检疫。《生猪屠宰管理条例》的第十条要求“生猪定点屠宰厂(场)屠宰的生猪，应当依法经动物卫生监督机构检疫合格，并附有检疫证明”。
合格的，才能加盖检疫验讫印章；不合格的，要按相应的流程处理，并不会进入市场。除了检疫合格，猪肉还需要经过品质检验。品质检验合格的，需要 “加盖肉品品质检验合格验讫印章或者附具肉品品质检验合格标志”。
参考资料来源：
人民网-食品频道：猪肉上不同颜色的印章是用来判断优劣的吗
