从前，有一个小镇叫圣彼得堡，小男孩汤姆索亚因母亲逝世而被波莉姨妈所收养。他活泼调皮，是大人们心中的调皮鬼。
一次，他和朋友哈克贝利芬恩为了测试胆量到墓地里去埋葬死猫，意外看见了杀人犯英琼•乔杀害鲁滨逊医生，却冤枉是莫夫•波特杀害的。后来，即使他害怕被凶手报复，依然勇敢地指出来，帮莫夫波特澄清事实。
他因为厌倦呆板的学校和刻板乏味的生活，和伙伴们一起来到小岛上扮演海盗，过着自由的生活。还没过多久，他又现身在自己的“葬礼上”。
汤姆和哈克因为相信世上一定会有埋葬的巨款，于是来到了镇上所谓的鬼屋里去探险。但是又意外的撞见了乔和另一个人，他们提到了要把鬼屋里的那款巨款藏到一个叫“2号”的地方去。于是汤姆和哈克开始跟踪乔，希望能找到2号。
回到学校，汤姆和贝奇开始互相折磨。但不久贝奇又被汤姆所作所为所感动了。恰逢一天，贝奇、汤姆和小伙伴们一起到山洞里戏耍。汤姆被山洞里各种各样的奇形怪状的石头所吸引了，便和贝奇两人独自不断往里走，突然他们发现迷路了。汤姆凭借他智慧和勇气顺利帮助贝奇两人一起脱险。
在山洞里汤姆撞见了乔，对“2号”恍然大悟。在汤姆的指示下，他和哈克成功地找到了宝藏，挖出了巨款，发了横财。哈克因为不能忍受被束缚，所以打算继续去当海盗。但最后在汤姆的说服之下，回归到了文明社会。
