春秋时属晋国，元朝设晋州，民国二年改晋县。州、县皆晋国而得名。春秋时名为鼓国，属钜鹿郡，城址在今鼓城村。西汉时开始建县，为下曲阳。后魏改称下曲阳，县治均在鼓城村（原名坡城）。北齐废除曲阳县并入藁城。隋开皇十六年（596年）又从蒿城分出恢复建县，名为昔阳县，开皇十八年（598年）更名为鼓城县，隶属赵郡。元太祖十年（1215年）由县上升为州，名晋州。
民国二年（1913年）改州为县，称晋县。民国28年（1939年）1月16日，晋县被日军侵占。为抗日所需，1940年5月，以石德铁路为界，路北建晋北县，路南建晋（南）县，1941年晋（南）县与蒿城南部及正定县部分区域合并建晋蒿县，晋北县与深泽、无极合并为晋深极县，1942年晋深极县与束北县合并成立束晋县，均属冀中八专署。
1945年9月3日，日军北离晋县，恢复原晋县建置，晋县西留章村划归蒿城，辛庄划归无极县。1956年水灾后，无极县滹沱河南龙泉固村划归晋县。1958年11月，晋县、深泽并入束鹿县。1961年5月析束鹿县复置晋县（含深泽县）。1962年1月析晋县复置深泽县；晋县耿庄划归深泽县。1991年11月30日，经国务院批准撤销晋县，设立晋州市（县级）。
1956年7月撤区并乡，全县辖23个乡，1957年重新划为19个乡。1958年晋县成立6个大公社。2000年，晋州市辖8个镇、2个乡：晋州镇、马于镇、总十庄镇、小樵镇、营里镇、东卓宿镇、槐树镇、桃园镇、东里庄乡、周家庄乡。
2000年第五次人口普查，晋州市常住总人口520942人，其中：晋州镇117654人，总十庄镇51670人，营里镇32353人，桃园镇52909人，东卓宿镇43595人，马于镇42671人，小樵镇57906人，槐树镇56204人，东里庄乡50898人，周家庄乡15082人。
2002年，晋州市面积619平方千米，人口约51万人。辖8个镇、2个乡，9个社区、224个行政村。市政府驻市府街60号。
2010年第六次人口普查，晋州市常住总人口537679人，其中：晋州镇135521人，总十庄镇49014人，营里镇31981人，桃园镇53826人，东卓宿镇45748人，马于镇42147人，小樵镇59880人，槐树镇54246人，东里庄镇48686人，周家庄乡16630人。
全市现辖9个镇、1个乡：晋州镇、总十庄镇、营里镇、桃园镇、东卓宿镇、马于镇、小樵镇、槐树镇、东里庄镇、周家庄乡。
