一、根茎区别
石菖蒲的根茎粗度为2-5mm左右,并有着淡淡的芳香,它的颜色为淡褐色,根茎是肉质的,上面还有很多的须根,节间的长度通常为3-5mm。
水菖蒲的根茎是横走的,粗度是5-10mm左右,同样有芳香,但它是黄褐色的。它的肉质根是5-6cm左右,须根都是毛发状的。
二、叶子区别
石菖蒲的叶子是很薄的,是线性的,长度差不多是在20-30cm左右,有时可达到50cm。它的叶色为暗绿色,无中肋。
水菖蒲的叶子是剑状的线形,长度会更长一些,有90-150cm左右。它的叶子为绿色,十分光亮,有着十分明显的中肋。