三只松鼠于2012年成立，公司总部在安徽芜湖，是中国第一家定位于纯互联网食品品牌的企业，也是当前中国销售规模最大的食品电商企业。
2014年，安徽三只松鼠电子商务有限公司再次获得今日资本、IDG资本两家境外基金第三轮1627万美元，用于三只松鼠智能一体化食品园项目建设。
2015年9月16日，三只松鼠创始人章燎原在安徽芜湖宣布，三只松鼠已获得第四轮融资，总金额达3亿元人民币，三只松鼠估值40亿元。
2017年04月22日，休闲食品电商“三只松鼠”正式提交上市招股书，拟登陆创业板。08月15日药监总局关于3批次食品不合格情况的通告指出，天猫超市在天猫（网站）商城销售的标称三只松鼠股份有限公司生产的开心果，霉菌检出值为70CFU/g，比国家标准规定高出1.8倍。
2017年12月12日，证监会发布公告称，鉴于三只松鼠股份有限公司尚有相关事项需要进一步核查，决定取消第十七届发审委第72次发审委会议对该公司发行申报文件的审核。根据证监会此前安排，三只松鼠的IPO申请会在12月13日上会接受审核。
2018年6月25日，证监会网站显示，三只松鼠正进入IPO排队阶段，其审核状态显示为“预先披露更新”。
2018年三只松鼠营业额高达70亿元，净利润3.04亿元，净利率4％。
2019年7月12日，三只松鼠食品股份有限公司（简称“三只松鼠”）在深交所挂牌上市，股票简称为“三只松鼠”，股票代码为“300783”。
2019年12月3日，三只松鼠宣布，2019年其全年销售额突破百亿，成为零食行业首家迈过百亿门槛的企业。
