水花生地下根系发达，仅靠杀灭地表的茎叶不能从根本上解决水花生的持续危害，一般来说水花生防治方法如下：
1、用使它隆防除稻田田埂、渠边、沟边的水花生，防效达95％以上。每亩用20％使它隆乳油50－60毫升，对水50－60公斤均匀喷雾。从水花生发芽到旺长期均可施药防治。施药时不能将药液喷在大豆、花生等阔叶作物上，以防造成药害。
2、防治圩埂路旁、河沟边的水花生，用水花生枯防效显著。在水花生发生始盛期，用10．5％水花生枯16克（1包），加清水10公斤喷雾，可以防除200平方米面积的水花生。施药后，水花生很快发黄，一周后茎叶枯死，根也被杀死。一般连续使用2年，可消除水花生危害。
3、水旱轮作可以抑制水花生滋生蔓延。采用水花生专用除草剂水花生净（水剂）、水花生光（粉剂），于水花生发生初期对水喷雾，当地上部分黄萎后又现青时，再次用药，可以将水花生连根杀死。经过连续2－3年防治可以根除水花生。在水花生发生较重的地方，可以用灭生性除草剂农达防除。选晴好天气定向喷雾，以免药液飘到农作物上造成药害。
4、用农达、克无踪可以防除水花生。每亩用41％农达200－300毫升，加水20－30公斤，将药液均匀喷洒在长出水面的杂草和路旁杂草上，药物被杂草茎叶吸收，并传导到根茎组织，发挥除草作用。一般用药后7－10天，水花生等杂草即被连根杀死。农达对鱼无毒，可防治长在水面的杂草。每亩用12．5％克无踪250毫升，加水25公斤喷细雾。晴天施药后2－3小时，杂草绿色部位开始发黄，3－4天内枯死。克无踪只对杂草绿色部位有杀伤作用，不能在植株内传导，不能杀死地下茎，药物接触土壤后失去活性。用克无踪防除池坡、圩埂杂草不杀死草根，有利于保持水土。
5、在水花生生长期，每亩用48％百草敌水剂60毫升，或25％虎威水剂150毫升，或10％草甘膦水剂2000毫升，或20％克无踪水剂300毫升，对水40公斤喷雾，防治效果达85％－95％。
