第一、诸葛亮虽然是一个文人,但是一辈子所做之事基本上都是武将的事。诸葛亮从刘备三顾茅庐出山之后,虽然没有像其它武将一样手执兵器冲锋陷阵,但基本都是为打仗出谋划策,著名的战绩有火烧赤壁、去荆州入巴蜀、南征四郡、六出祁山等,基本上都是一个武将才干的活计,从这点上来讲,诸葛亮一个文人进武庙是再正常不过的事情。
第二、武庙没有规定文人不能进。武庙主要是祭祀姜太公和历代良将的,历史上文人成将的比比皆是,有一些武将是文武双修,因此,武庙虽然是纪念良将的,但是并不是文人不能成将,在历史上除了诸葛亮以外,宋朝和明朝也都有很多文人成为武将的案例,因此诸葛亮一个文人进武庙也是很正常的事情。