中华菊头蝠分布于中国东南、西南、陕西等地，其中分布在温带地区的菊头蝠在冬季要冬眠。广泛分布于香港各区。华南、尼泊尔、印度北部及越南。新闻事例：香港大学医学院证实中华菊头蝠是SARS病毒的主要传染源。（SARS，俗称“非典”，2003年震惊世界的高致病传染型病毒）
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