引起发情不正常的原因主要有以下几点：
1、饲养管理因素
母猪过肥和过瘦，缺乏运动，光照，营养不良（蛋白不足或氨基酸不平衡，维生素矿物质不足等）。
后备母猪在第一胎哺乳过程中，出现了过度哺乳的现象，从而使母猪子宫恢复过程延长。
没有受到公猪的相应刺激，可用公猪追逐爬跨或调到离公猪圈近的圈舍，一般约有近一半的母猪在调栏后的10天左右出现发情症状。
年龄与胎次，母猪年龄大未达到绝情期，未老先衰，即出现不发情或发情期不明显。
初配体重，据观察，体重在120公斤～130公斤初配产仔数较高，断奶后乏情发生较少，断配间距小，此时断奶当日注射PMSG或PG—600，一般约有80%以上的猪在7天～8天内发情。
2、玉米赤霉烯酮（F-2毒素）对母猪的影响
玉米赤霉烯酮（F-2毒素）主要由禾谷镰刀菌产生，存在于玉米、麦类、高粱、稻谷中，主要危害猪的生殖系统。
临床症状：猪群发生F-2毒素中毒的临床症状随接触剂量和猪年龄不同而异。①玉米赤霉烯酮可引起初情期前的后备母猪阴道炎，分泌物增多，外阴红肿，出现假发情；早熟性乳房发育，乳腺肿大；黄体滞留、不发情。②断奶后母猪发情延迟，返情率上升，发情不正常，屡配不孕或假怀孕现象；长期饲喂则引起卵巢萎缩、发情停止或发情周期延长。怀孕母猪出现胚胎早期死亡或胎儿畸形，引起流产、死胎、产仔数减少（产仔数可减少0.8头～1.5头），严重时直肠、阴道、子宫脱出。③哺乳母猪饲料采食量减少、泌乳量下降，仔猪断奶体重轻、不好养、抗病能力低。断奶后母猪发情延迟、配种率不理想，部分屡配不孕；受胎率可下降12%左右，母猪可用年限少。母猪卵泡变性，淘汰率偏高，使用年限缩减。
解决方法：母猪饲料长期添加高档脱霉剂，因为只有好的脱霉剂才能有效吸附霉菌毒素，并且不会对饲料中的维生素产生影响，从而不会出现由维生素缺乏引起的繁殖障碍。建议使用中威纽曼星，每吨饲料添加1公斤。
3、母猪内分泌异常
如卵巢囊肿、持久黄体时母猪也不发情。患有卵泡囊肿的病母猪多肥壮，发情周期紊乱。个别猪性欲亢进、频繁、不规则、长时间持续发情，达7天～10天(慕雄狂)，这些猪外阴充血、肿胀，常流出大量透明黏液分泌物，但屡配不孕或个别受孕，但产仔多在7头以下。此病多数都是断奶猪，后备猪很少发生卵泡囊肿。一侧单个小囊肿也许不干扰发情周期，有的也可受孕，但是母猪排卵数以及胚胎存活率将受到不同程度的影响。黄体囊肿的病母猪临床表现为缺乏性欲，间隙或长期的不发情，容易误认为怀孕。
卵泡囊肿应用垂体促黄体素(LH)：虽然此药是传统用药，但实践证明现在仍然是治疗卵泡囊肿的良药，应用LH100IU～200IU，肌肉注射2次～3次。LH可用绒毛膜促性腺素(HCG)代替，用药量为每头500IU～1000IU，肌肉注射2次～3次。LH或HCG可促进囊肿的卵泡黄体化，注射后14天注射氯前列烯醇钠，将敏感期间的黄体消除，可促使新一轮发情周期的开始。
黄体囊肿可用前列腺素(PGF2α)及其类似物：PGF2α对黄体有强烈的溶解作用,目前国内常见的PGF2α类似物有氯前列烯醇钠(PG-CI)和律胎素等。氯前列醇钠肌注为0.1毫克～0.2毫克/头，律胎素1头份。
4、传染病和寄生虫病
许多传染性疾病如猪瘟、阴性蓝耳、布氏杆菌病、沙门氏菌病、细小病毒病、支原体病、衣原体病、乙型脑炎、阴道滴虫病等均可造成流产、木乃伊、胎衣排出不全而导致断奶后长期不发情。
解决方法：定期给母猪做保健，预防疾病，可每吨饲料添加中威银翘散1000克、妙立素125克、威普健500克、中威聚能星500克，每月连用7天；对于已经出现发情不正常的猪群，可以按照每吨饲料添加雅博3000克、利呼宁1000克、中威聚能星500克，连用7天～10天，效果明显。
当然还有一些属于先天性因素：生殖道畸形，这种母猪的胎儿，在子宫内发育有障碍且发育异常。这种母猪一般不会性成熟或不能正常发情；卵巢发育不全，小母猪长期患慢性呼吸系统疾病、慢性消化系统疾病、寄生虫病等易发生卵巢发育不全，从而导致不能分泌足够的激素而不能引起发情；两性畸形，从外观看上去像母猪，但实际上这种“母猪”具有公猪的性腺——睾丸，对这几种情况应及时淘汰。
