一、进入的方法不一样：进入秘境都是需要秘境钥匙的，小秘境需要通过完成悬赏任务获得小秘境的钥匙，使用小秘境钥匙即可进入。而大秘境钥匙是通过击杀小秘境的BOSS才有机率掉落，且角色等级达到70级，击杀小秘境BOSS获得大秘境钥匙，使用该钥匙才能进入大秘境。
二、关卡难度不一样：小秘境的难度就如同普通场景一样，蓝怪和金怪的出现机率比较普通场景要大，怪物比较密集不过层数有限，玩家可以全部清除再击杀BOSS。大秘境有等级限制，因此难度比较难，玩家需尽快击杀BOSS。
三、击杀怪物掉落奖励不一样：小秘境的任何怪物都有可能掉落各种道具、装备和金币。正常进入小秘境推荐全图清空再击杀BOSS。相反，大秘境的除了秘境BOSS外其余怪物均无道具、装备、金币掉落。
四、通关秘境奖励不一样：小秘境志在清空全图从而将秘境收益最大化，完成小秘境出来交的任务奖励可以完全忽略，因此小秘境慢慢刷就好。而大秘境BOSS会高机率掉落传奇装备和套装装备，且必定出现一颗传奇宝石。
五、关卡玩法的不一样：玩家进入小秘境推荐认真的清扫地图每个角落的怪物，就算能槽满了BOSS出现也可以继续转悠。而大秘境玩家必须抓紧时间畜满能槽，当能槽满了秘境的小怪会自动清空只剩下秘境BOSS。通过大秘境时间越短奖励越大。
