吉姆是一个住在海边小镇的十岁男孩。一天，一个奇怪的船长来到了他的酒店。像是在躲什么人。过了几周，那些要找船长的人来了，他们不怀好意，对船长下了“黑色通牒”。但船长在他们走后就意外地死去了，只留下一只大箱子，里面装着许多钱和一个黄布包。吉姆打开那个包一看，原来是海盗弗林特的宝藏的藏宝图。就这样，吉姆决定和李维西医生、居劳尼先生、史莱德船长和一批船员出发去寻宝。船上一共有26人。
可是没想到，船上混入了同样想得到宝藏的海盗。一天，吉姆躲在苹果桶里，听到了西尔巴、汉斯、迪克等几个海盗的阴谋：他们计划在找到财宝后返航时动手。吉姆迅速将这些告诉了史莱德船长等人。形势十分不利，可以确定的不与海盗勾结的人只有七个。
大家终于来到了埋藏宝藏的岛上。史莱德船长计划让西尔巴等人下船，自己和李维西医生、居劳尼先生便可控制大船。但吉姆也不小心下了船，在岛上目睹西尔巴杀死了两个可信任、忠诚的船员。吉姆撒腿就跑，遇到一个叫“班”的人。他原先也为福林特做事，但后来被放逐了，在岛上独自生活了三年。他知道宝藏在哪儿。可这时，远处的战斗打响了。
李维西医生等人放弃了大船，退到岛上的木碉堡抵御海盗的进攻。在战斗中他们消灭了不少海盗，但居劳尼先生的三个仆人也不幸牺牲了。这时吉姆也来到了木碉堡。但吉姆的冒险心和突然出现的鬼主意又驱使他溜了出去，偷偷靠近了大船，并割断了锚绳，让大船漂到了远处，此时留在船上的海盗只有汉斯一人了，他试图攻击吉姆，但未能得逞。吉姆将大船开到了岛的另一边，可一上岸就被西尔巴抓住了。海盗带着吉姆来到了宝藏埋藏地点，但只有一个空空如也的大坑。原来都早已被班那去了。海盗们对西尔巴越来越不满，这时李维西医生等人有赶到了，消灭了所有海盗。
吉姆带着宝藏回到了英国。他不但得到了一部分宝藏，也收获了一次奇妙的历险。
