首先，需要选择健康、成熟的木瓜果实，切开果实并取出果籽，清洗干净后放在凉水中浸泡1-2小时，随后将白色的种皮剥掉，以免阻碍发芽。
然后，将种籽装入培养土中，埋深3-5厘米，浇透水后放置在阴凉通风的位置，一周内每天喷水一次，约两周左右发芽生根。
接着，逐渐适应光照，待幼苗成长到一定高度后进行移栽。
(1)扦插繁殖
每年2―3月、6―7月、11月都可以进行扦插育苗。但以11月扦插成活率高，可达85％。扦插时，从母树上选取1―2年生、发育充实、无病虫害，已经完全木质化的枝条，直径0.5―0.8厘米之间，然后截成15―20厘米的插穗，每插穗具3个节以上，把下端近节处削成斜面，切面放在0.05％生根粉或0.05％―0.1％素乙酸中快速浸蘸10-15秒钟，取出稍晾，便可扦插。扦插时先在整好的育苗地的畦面上按行株距15厘米×7厘米用小木捧打引孔，然后将插条半截以上轻轻插入孔内，压实，浇透水，覆土与畦面齐平。扦插后在畦上盖弓形塑料薄膜棚，保温保温。土壤干旱时要经常淋水，保持育苗地湿润。如天气严寒，棚上加盖草帘保温；晴朗温暖天气揭开薄膜通风换气，到第2年清明天气回暖，插穗便生根萌芽到4月中下旬将弓棚拆除。加强管理，及时中耕除草追肥，经一年培育，苗高70―80厘米时可以栽种。
