一）土壤管理。每年冬闲季节，结合浅耕培土，在树冠滴水线向外挖1～2个长40～60厘米、深60～80厘米的施肥穴，按每平方米施入100千克的堆肥（或厩肥），将其与土壤混合均匀，有利于培养幼树发达的吸收根，增强树体对养分的吸收功能。
（二）肥水管理。幼树一般年施肥5～10次，做到勤施薄施，肥料种类以速效性氮肥为主，配合施用磷肥、钾肥和人畜粪。定植苗从3月份春梢萌发开始到9月份秋梢抽发期，每月施1次30%浓度的腐熟人畜粪水。对一年生柠檬幼树，通常年施氮(N)80克，磷(P2O5)40克，钾(K2O)30克，以后逐年增加10克左右。2～4年生幼树，施肥时期集中在各次嫩梢抽生前进行，年施肥次数 5～6次，并在嫩梢期进行3～4次叶面喷肥。
柠檬树对于土壤的要求不高，可以使用腐殖土两份，土杂肥一份，河沙一份拌匀之后栽种。柠檬树是木本植物，根系比较的旺盛，但是恢复能力一般，为了避免频繁的换盆伤根，上盆的时候选用的土壤最好耐用一点。
柠檬树比较怕冷，最佳的生长温度在18度到28度之间，冬天最好入室养护。柠檬树的耐寒能力不高，当温度接近零度的时候，就会出现落叶的情况。短暂的低温不会导致柠檬树死亡，入室是为了能够安全的生长，避免出现冻伤。
给柠檬树施肥，每两个月撒施一层缓释肥，半个月冲施一次硫酸亚铁。缓释肥的肥效一般能够坚持两个月的时间，由于柠檬树喜欢微酸性的土壤，而且缺铁容易导致黄叶，定期的补充硫酸亚铁预防黄化病。
柠檬树常见的病害有炭疽病、流胶病、褐斑病、叶斑病等等，一般可以使用多菌灵搭配阿维菌素喷施即可。家庭种植的过程中，主要是保持通风性，出现病害的情况一般比较少。
