1.堆肥发酵处理
堆肥发酵的主要原理是利用各种微生物来分解牛粪中的有机成分，将牛粪与其他有机物混合在一起，在适当的条件下进行堆肥处理，发酵过程中形成的特殊理化环境也可基本杀灭粪中的病原体。堆肥处理方法是最简单的一种处理牛粪的方法，堆肥过程不需要专用设备，处理费用低，堆肥后形成的有机肥料，可以直接用于作物种植。
2.加工生产有机肥
牛粪可以通过微生物发酵技术彻底杀死其中的有害病菌，使粪便成为无臭、完全腐熟的活性有机肥。通过加工生产有机肥，可以让养牛场实现优质、高效、低耗生产，提高生产效益，实现牛粪的资源化、无害化、无机化循序利用。牛粪生产的有机肥，能够广泛用于农作物种植、城市绿化以及家庭花卉种植等。
3.用于饲养蚯蚓
当前，很多地方的牛粪都选择用于饲养蚯蚓，既解决了牛粪无处堆放的问题，又能够通过饲养蚯蚓获得更多收益，形成养牛—牛粪养蚯蚓—生产绿色生态肥料—促进农作物生产的良好循环。在利用牛粪饲养蚯蚓时，饲养场地最好选用地势比较平坦，能灌能排的菜园、果园或饲料田，蚯蚓养殖的最佳密度以每平方米3公斤左右或每平方米2万条为宜。
4.用于生产沼气
牛粪中含有大量有机物，这些有机物可以在高温、厌氧条件下经厌氧微生物降解成沼气（主要成分为甲烷），同时杀灭粪水中的有害微生物。产生沼气后，既可以将沼气作为生活能源，又能将生成所用的残渣作为肥料用于农作物施肥。
