1、常温保存 可以把黄豆芽放在水中浸泡。把没有吃完的黄豆芽清洗干净之后，将它们泡在水里面，然后把它们放到通风、阴凉的地方，不过这种保存方式容易流失黄豆芽的营养物质，也不适合久存。
2、冰箱保存 把豆芽的根须掐掉之后清洗干净，沥干水分之后把它放到保鲜袋中，尽量排出保险袋中的空气，然后打个结，之后再套一个保鲜袋，再打个结，这样可以可以最大限度地把空气排出来，最后把它们放到冰箱冷藏。
豆芽物美价廉，质地清脆可口，鲜嫩味甜，由于豆芽含水量很大，保存起来不方便，有没有什么好的保存方法呢？根据豆芽质地娇嫩，含水量大的特点，一般保存起来有两种方法，一种是用水浸泡保存，另一种是放入冰箱冷藏。但豆芽长时间用水浸泡容易导致营养物质的流失，而且有实验研究表明，温度是影响绿豆芽褐变与黏腐的主要因素，因此，放冰箱低温保存更适合。有许多人试图用热水焯过保存，但实际上这种保存效果更差。 若买多了，先将剩下的豆芽择洗干净，褐变的豆芽都要丢弃，掐掉根须，因为根须上易沾有更多的细菌，若不丢弃会加速豆芽的腐变。然后用清水洗净，控干水后密封装进保鲜袋中，尽量排出袋内的空气，打好结，再将另一保鲜袋套上，再打上结，使外界空气不能进入或进入少许，放入冰箱保存，但不宜超过两天。 不同的豆芽保存的时间长短也不一样。黄豆芽保存的时间较长，绿豆芽则较短。
