1、化学组成不同:低聚果糖通常就是果糖的一种,而且稳定性比较强,在酸性的条件下加热比较容易分解,但是第1句半乳糖通常就是半乳糖以及葡萄糖所组成的杂低聚糖,并且对酸和热都是比较稳定的;
2、生物功能不同:低聚果糖通常属于水溶性膳食纤维,一般会被双歧杆菌以及乳杆菌等有益菌选择利用,而且属于高效双歧杆菌增殖因子,但低聚半乳糖通常就是肠内双歧杆菌促进因子,能够促进钙以及镁等矿物质吸收,低聚半乳糖也可促进人体消化吸收,改善乳糖不耐受;
低聚果糖耐寒,而低聚半乳糖耐酸耐热。
低聚半乳糖在加工过程中不会被高温杀菌和人胃酸破坏,但低聚果糖没有这些特点,相对而言,低聚半乳糖的成本高于低聚果糖。