第一：按颜色分类，玛瑙可以分为：红玛瑙，绿玛瑙，蓝玛瑙，紫玛瑙等，其中又以红玛瑙最受大众喜爱，而在红玛瑙中，南红玛瑙是近年来市场上最热门的吗玛瑙。而紫绿玛瑙则因为独特的双色，而受到了玉雕师的喜爱，近年也是身价倍增。
战国红玛瑙手串
第二：玛瑙的纹路分类，可以分为缟玛瑙、缠丝玛瑙、象形图纹玛瑙等，其中缟玛瑙又称条纹玛瑙，料子上常见有黑白条纹相间或是红白条纹相间，而缟玛瑙中最出名的当属战国红玛瑙，主要是以红黄两色为主，用战国红玛瑙做成的玛瑙手串，是很多玛瑙发烧友追捧的对象。收藏价值也很高。
主要有三种玛瑙
1：戈壁玛瑙，古称“赤玉”或“琼”。玛瑙石坚润晶莹、色韵雅丽、玲珑娇小，在众多戈壁石种中独树一帜，被誉为“大漠精灵”、“戈壁瑰宝。戈壁玛瑙主要为火山热液型和砂矿型、鄯善沙尔湖、克拉玛依乌尔禾、巴楚、和田等地的荒漠地区均有产出。
2：哈密伊吾玛瑙：总体特征是色彩亮丽，纹饰优美，变化奇异，种类较多。以质赏和纹赏为主，色韵俱佳的景观石为最佳。常见白、黄、红、褐等色，透明至半透明，常见椭球状、不规则次浑圆状，主要品种有缠丝玛瑙、闪光玛瑙、竹叶玛瑙、柴状玛瑙、碧玉玛瑙、空心玛瑙、响石玛瑙等。
3：巴楚黑山玛瑙：新疆巴楚黑山上有一种玛瑙当地人把它起名为黑山玛瑙。天然黑山玛瑙石又称好运石，风水石。玛瑙是千万年前火山喷发出大量岩浆，热液充填早期洞隙后形成的矿物质。各种矿物质相互作用后变成五颜六色、形态万千的岩浆凝结体，多数为较小的粒状，大块完整像形的极为罕见
