1、缺氧黑心
根部缺氧引起的黑心，将根部切开后会发现肉质根木质部变黑，出现很多的黑色小点，不能食用。这时萝卜在田间施用大量的未腐熟或腐熟不好的有机肥引起的，尤其是圈粪，会到土壤中微生物活动旺盛，氧气消耗过大，造成根部窒息，部分组织因缺氧而引起黑心或者黑皮现象。
防治方法：种植萝卜的地块要深翻整平，保持土壤疏松，增加通透性，施用有机肥或农家肥时一定要经过充分腐熟，合理浇灌，加强中耕，供应根部氧气充足，促进其健康生长，雨后及时排水，以免积水造成黑心或黑皮。萝卜在储藏时要适量，不能超过窖容的一半，加强通风换气工作，控制窖内较低的温度和湿度。
2、缺硼黑心
硼是萝卜生长不可或缺的元素之一，缺硼极易出现黑心、空心、烂心的现象，缺硼原因一是土壤汇总缺乏硼元素，二是因为偏施某种元素，抑制了根系对于硼元素的吸收，三是在高温干旱环境下也会影响到根系对于硼元素的吸收，从而造成缺硼。
防治方法：在基肥施入是加入300-400克的硼砂，将其和其它肥粒充分混匀条施，或者在生长期采取叶面肥喷硼的措施，一般在萝卜出现2-3片真叶时至收获前，可以每隔10天喷施一次0.2%的硼酸或0.3%的硼砂水溶液，一共喷施三次。另外还要保持田间湿润，促进根系对于硼元素的吸收，要防止干旱，生长期及时浇灌。
3、黑腐病黑心
黑腐病是一种细菌引起的病害，主要危害根叶，苗期发病是子叶呈水浸状，根髓变黑腐烂，叶片发病时，整叶会逐渐变黄干枯，病菌还会沿叶脉想茎和根防止，导致全株叶片变黄枯死。肉质根染病后，横切萝卜可看到维管束呈放射线状、黑褐色，严重者呈干缩空洞，维管束溢出菌脓。
防治方法：避免和十字花科蔬菜连作，种植时选择抗病力强品种，使用50%的福美双可湿性粉剂（按种子重量0.4%）拌种后再播种。要及早防治黄条跳甲、蚜虫等害虫，发病初期可以喷洒加瑞农、络氨铜水剂、农用硫酸链霉素等药剂繁殖，每隔7-10天喷施一次，连续2-3次。
