行政性质不同、地理位置不同等。
1、雁塔区是西安的一个行政区。高新区是西安的高新技术开发区，没有行政编制。西安高新区是雁塔区的一部分，而雁塔区不止高新区一个区域。
2、雁塔区是一个同县一级的行政区，而高新区不是行政区，只是一个技术产业开发区它是在雁塔区，长安区之内的一个开发区要是非要区分的话，到高新路向西到丈八北路，向南到长安区偏北，它一部分是在雁塔区之内，一部分是长安区之内。
3、行政区类别上有所不同，雁塔区的行政区类别为市辖区，高新区的行政区类别为开发区。
4、高新区的生产总值只单纯计量高新区所有企业总值，而雁塔区生产总值包含高新区的部分生产总值外还包含雁塔区其他辖区内其他单位和企业产值。
5、高新区是为了促进发展而设立的一个区域，是西安市政府的派出机构，也就是市直机关，在一定区域内代表西安市政府行使市级相关职能，但是在西安市看来，行政上各区县与开发区是平行的，承担的任务与责任一样的。
6、雁塔区是一个行政区，而高新区只是一个西安的开发区，不属于西安的9区之一，没有行政职权（所以雁塔区的行政单位是雁塔区政府，但是高新区只有高新管委会，这个和曲江管委会一样。）。高新区属于雁塔区，高新路(光华路)肯定属于雁塔区了。
7、雁塔是行政区，高新是高新管委会，高新管委会和雁塔行政区是平级单位，虽然位于这些行政区内，但是高新区内的土地是归高新区管控的，其他行政职能也是高新管委会履行。在统计GDP的时候高新的部分GDP是归到雁塔的。
