如果您在交管12123平台上未及时缴纳违章罚款，但扣分已经生效，可能有以下几种情况：
1. 系统延迟更新：有时候，扣分和罚款的信息可能会存在一定的延迟。即使您尚未缴纳罚款，但系统可能已经更新了扣分信息。在这种情况下，您仍然需要按照规定缴纳罚款。
2. 其他渠道缴纳：如果您通过其他渠道（例如银行、现场办理等）缴纳了罚款，但尚未在交管12123平台上更新，请确保您能够提供有效的支付凭证，并与当地交管部门联系解决。
3. 信息错误或系统问题：偶尔会发生数据录入错误或系统故障等问题导致扣分和罚款信息出现异常。如果您确认自己没有违章行为且未缴纳相关罚款，请及时联系当地交管部门进行核实和处理。
无论是哪种情况，建议您尽快与当地交管部门取得联系并说明情况。他们将能够提供更准确的解释和指导，以便解决该问题。
是因为数据延迟的原因，可以选择去交警队查询。
因各地交管互联网平台与公安网络数据交换存在“时间差”(通常情况数据交换延时约为一小时)，如果已在某个平台或是渠道自助处理了交通违法，请耐心处理完成及等待数据更新。切勿在其他平台对该条违法进行再次处理，否则可能会造成该起违法的重复缴款问题。
另外，根据《道路交通安全违法行为处理程序规定》的规定，交通违章罚款逾期的后果：
1、现场单超过15天没有缴款，从第15天后起每天产生罚款金额3%的滞纳金，直至交款为止;(备注：滞纳金最高不超过罚款金额);
2、违章超过3单以上未处理的，交警核查到，会被扣证，情节严重的还会被扣车;
3、现场单未处理的，驾驶员的驾驶证要换证、补证或转证都不能办理;
4、章未处理的，发生事故、车损等，都将得不到车辆保险公司的理赔;
5、违章未办理的，不能通过车辆年审、季度审和综合审。
