大灭绝是由气候突变、沙漠范围扩大、火山爆发等一系列原因造成。科学家认为，在二叠纪曾经发生海平面下降和大陆漂移，这造成了最严重的物种大灭绝。那时，所有的大陆聚集成了一个联合的古陆，富饶的海岸线急剧减少，大陆架也缩小了，生态系统受到了严重的破坏，很多物种的灭绝是因为失去了生存空间。更严重的是，当浅层的大陆架暴露出来后，原先埋藏在海底的有机质被氧化，这个过程消耗了氧气，释放大量二氧化碳。大气中氧的含量有可能随之减少了，这对生活在陆地上的动物非常不利。随着气温升高，海平面上升，又使许多陆地生物遭到灭顶之灾，海洋里也成了缺氧地带。地层中大量沉积的富含有机质的页岩是这场灾难的证明。
二叠纪物种大灭绝，是历史上最为严重的一次，却也是最具意义的一次。由于绝大多数物种都已灭绝，地球上的物种进行了一次彻底的更新换代，地球史也从古生代进入到中生代。经历了这次洗牌，在进入三叠纪之后，爬行动物成为地球上的绝对统治者，而恐龙、哺乳动物也开始出现。地球生命在经历这次重大的打击之后，又重新上路，向着更为高级、更具智慧、适应能力更强的形态不断进化，为最终人类的出现奠定着基础。陨石撞击
陨石撞击
有些科学家认为，陨石或小行星撞击地球导致了二叠纪末期的生物大灭绝。如果这种撞击达到一定程度，便会在全球产生一股毁灭性的冲击波，引起气候的改变和生物的死亡。最近搜集到的一些证据引起了人们对这种观点的重视。但大多数生物科学家认为这场灭绝是由地球上的自然变化引起的。气候改变有些科学家认为，气候的变化是造成这场大灾难的主要原因。因为二叠纪末期形成的岩石显示，当时某些地区气候变冷，在地球两极形成了冰盖。这些巨大的白色冰盖将阳光反射回太空，会进一步降低全球气温，使陆上和海中的生物很难适应。如果再加上海平面下降和火山爆发，这样就会成为灭顶之灾。大气成分改变有些生物学家认为，生活方式比较活跃、积极的动物，如类似哺乳类的单弓类动物需要比别的动物更多的氧气，它们可能是因为大气成分的改变而灭绝的。因为二叠纪末期气温的降低会导致海平面的下降。海床的辽阔煤层区就会暴露在外面，释放出大量二氧化碳到大气中，大气中的氧气含量就会相对减少。火山活动火山爆发会喷出大量气体和火山尘埃进入大气层。火山灰、尘埃不仅会使动物窒息而死，也有可能遮蔽太阳光，使全球气温降低。所以，火山活动也可能是二叠纪末期灭绝事件的原因之一。西伯利亚就曾经发现当时火山猛烈爆发所喷出的物质。沙漠肆虐二叠纪的陆块碰撞接壤而形成了庞大的盘古大陆。来自海上的雨水和雾气再也无法深入内陆地区。于是二叠纪的某些区域就越来越干燥、火热，致使沙漠范围越来越广，无法适应干旱环境的动植物就灭绝了。猜想一 天外来客“砸死”地球生物天外来客 从上世纪80年代开始，中科院南京古生物研究所就开始着手二叠纪末生物大灭绝的研究，带头领导这个项目的负责人是已故古生物专家金玉玕，接着好几位研究人员也相继加入。
南京古生物研究所的曹长群研究员说，通过对浙江长兴煤山等全球很多处二叠纪化石和地层的研究，金玉玕等最终推断出二叠纪末生物大灭绝是由两幕组成，一次发生在大约2.6亿年前，被称为前乐平世灭绝事件，这次生物灭绝事件与国家著名的峨眉山玄武岩喷发在时间上基本相同；另一次发生在二叠纪最末期(大约2.52亿年前)，这次事件灭绝速度快，影响的范围涉及全球几乎所有的化石门类，持续的时间短，估计在30万年内，这在地质年代上可以说是非常短暂的时期了。而二叠纪末生物大灭绝的原因，长期以来一直是一个争论的热点。2000年，金玉玕等人在《科学》上发表了论文，认为是瞬间事件导致了生物的灭绝，因为二叠纪末期发生的生物灭绝速度太快了。所以有美、日等科学家推断2.52亿年前有一颗小行星或者彗星猛烈地撞击了地球，其威力巨大，造成的强烈震波迅速席卷全球，瞬间杀死了上千平方公里内的所有生物。更厉害的是，这次撞击激起了巨量的尘埃，这些尘埃悬浮在空中遮天蔽日，一方面造成全球气温下降，另一方面又阻碍了生物的光合作用，使整个生态系统遭到严重破坏……如同6500万年前，恐龙的灭绝一样。当时，这种观点一度风靡一时，受到媒体和民众的普遍关注。当时的总总，让科学家们都认为罪魁祸首就是“天外来客”。但随后，随着进一步的深入研究，另一个可能的“凶手”逐渐浮出水面。猜想二 规模火山喷发导致大灭绝火山喷发 上世纪90年代，科学家在西伯利亚的冻土层下面发现了绵延数千公里的火山岩，这一套岩石的分布区被称为“西伯利亚大火成岩省”。实际上，二叠纪末的大规模火山活动从2.6亿年前中国的峨眉山玄武岩喷发一直到2.5亿年前西伯利亚的玄武岩大火山喷发。“当时西伯利亚的火山喷发面积特别巨大，相当于现在俄罗斯一半国土都是熔岩分布区。”
曹长群说，想象一下当时火山喷发的场面有多壮观：连绵数千公里的地壳被火山熔岩撕裂，岩浆如洪水般涌出，在数千万平方公里土地上肆虐蔓延……而且，我国华南地区位置这里也有火山爆发。那究竟是不是火山惹的祸，导致了当时地球生物的大灭绝？但曹长群说，西伯利亚大规模火山喷发只是导致2.52亿年前生物大灭绝的一个幕后凶手，它不是打死生物的那颗“子弹”。因为，2.52亿年前生物的灭绝只用了30万年，而二叠纪末大火山一直持续不断爆发了8百万年。如果是火山爆发导致生物大灭绝，为什么直到最后的30万年生物才突然灭绝？这就让火山爆发导致生物大灭绝，显得难以自圆其说。既不是陨石砸绝了地球生物，也难以用西伯利亚大火山来解释地球生物的最大灭绝事件，那究竟是什么原因导致了二叠纪末(2.52亿年前)生物的大灭绝？研究小组展示的全球古地理分布图。那时候，全球形成了统一的一个大陆，称为泛大陆。但中国大部还几乎是一片汪洋，整个华南处于古特提斯洋东侧。但随后，地壳发生了翻天覆地的变化。大陆板块构造出现了大运动，地震和火山喷发不断发生，让海洋和陆地渐渐分离。接着产生一系列连锁反应。 节肢动物的三叶虫只剩下少数代表，腹足类和双壳类有了新的发展。二叠纪末，四射珊瑚、横板珊瑚、筳类、三叶虫全都绝灭；腕足类大大减少，仅存少数类别。繁盛于古生代早期的三叶虫、四射珊瑚、横板珊瑚、蜓类有孔虫以及海百合等全部绝灭，腕足动物、菊石、棘皮动物、苔藓虫等也遭受严重的打击。这次灭绝事件对鱼类的影响相对较小，软骨鱼中的肋刺鲨类此时继续发展，旋齿鲨和异齿鲨都是其中的著名代表。二叠纪时两栖动物大量繁荣，常见的有迷齿类的蝾螈；爬行动物继续发展，代表分子有中龙等；哺乳动物的先驱—温血爬行动物兽孔类开始发展。植物的面貌在在二叠世晚期也发生重要变革，出现了繁荣于中生代的裸子植物如松柏类和银杏类。我国二叠纪植物群以大羽羊齿植物群为特征，称为“华夏植物群”。二叠纪的植物景观特点说明古生代的植物已趋衰退，逐渐过渡为另具一格的中生代植物。 2008年初，中科院南京古生物所年轻的科研人员曹长群等通过对我国新疆大龙口南翼和桃树园剖面的有机碳同位素研究发现二叠纪最末期存在两次负异常，从而将陆相生态系统的崩溃划分成两幕，并提出陆相生态系统对生物大灭绝的反映可能要早于海相生态系统的新观点，为探讨二叠纪末期生物灭绝事件的机制提供了新的解释。国际著名刊物EPSL网络版上已刊登该成果。这项研究结合海陆相地层中生物标记化合物、链状真菌/藻类残体和磁化率等证据的对比，建立了新疆陆相地层与我国煤山地区海相地层的二叠系－三叠系的碳同位素演变过程的精确对比关系，认为二叠纪末生物灭绝事件之前海陆相同时发生的有机碳同位素降低事件，是由于海平面降低而造成的富含硫化氢的静滞、缺氧的海洋环境的存在及其对大气和陆相生态系统的深层次影响。由于海、陆相生态系统对环境异常敏感度的差异，使得二叠纪末期陆相生态系统的反映要早于海相生态系统，从而支持2005年通过浙江煤山剖面钻芯样品研究所得出的结论，即海洋光合作用水体环境富含硫化氢为二叠纪末期生物灭绝的主导因素。该结论为南非Karoo盆地三叠纪代表性脊椎动物水龙兽的过早出现、二叠纪－三叠纪异常孢粉形态的出现和孢粉化石的混生过渡以及介形虫化石面貌的过早陡然变化提供了合理的解释。该研究也充分证明了我国以大龙口南翼剖面为代表的陆相地层发育更加完整的二叠纪－三叠纪过渡期沉积，更加优于澳大利亚和南极洲的陆相地层剖面。
