CD-R光盘可以刻录的格式目前有6种。
1. ISO-9660 ：简称ISO ，是由国际标准化组织在1985年制定的 ，目前唯一通用的光盘文件系统 ，任何类型的计算机和所有的刻录软件都支持它 。如果想让所有的CD-ROM 光驱都能读取刻录好的光盘 ，就必须使用 ISO-9660 或与其兼容的文件系统 。
2. Rock Ridge ：针对 UNIX系统的 ISO-9660文件系统 ，支持文件名字母大小写、符号字符以及长文件名 。由于兼容 ISO -9660， 所以即使操作系统不支持 Rock Ridge， 也可以通过ISO-9660 查看。
3. HFS：全称为混合文件系统 (Hybrid File System)，是苹果公司 (Apple)的MAC机所使用的光盘文件系统 ，不支持 DOS、Windows 9x/NT等其他操作系统 。
4. Joliet ：微软公司自定义的光盘文件系统 ，也是 ISO-9660 的一种扩展 ，支持Windows 9x/NT 和DOS，在Windows 9x/ NT下文件名可显示 64个字符 ，并可使用中文。
5. UDF：UDF 是统一光盘格式 (Universal Disc Format)的英文缩写 ，由国际标准化组织于1996 年制定的通用光盘文件系统 。它采用标准的包刻录技术 (PW ，Packet Writing)来简化刻录机的使用。UDF文件系统使用户可以如同操作硬盘那样来使用CD- RW刻录机。
6. Overburn ：支持刻录超过标准的 640MB盘片 ，最高可达 1GB，但刻录的盘片兼容性较差。
