个人所得税已缴税额和实际扣税有可能不一致，这可能是因为以下原因：
1. 个人所得税的扣缴计算按月进行，而年度应税所得额的计算是按全年累计的方式进行的。因此，如果全年的应税所得额超过了每月的税前扣除标准，那么实际需要缴纳的个人所得税就会超过每月扣的税款。
2. 个人所得税的计算公式比较复杂，包含多个税率和速算扣除数等因素。如果计算过程中出现误差，也会导致实际扣税和已缴税额不一致。
3. 如果个人存在多个工作单位或者从事多个收入来源，每个单位或来源扣缴的税款可能存在差异，也会导致已缴税额和实际扣税不同。
如果您发现个人所得税已缴税额和实际扣税不一致，可以向税务机关申报调整，核实并补缴个人所得税。同时，也可以咨询专业的税务机构或税务师，了解个人所得税的相关规定和操作程序。
之所以会出现纳税人已缴税额和已申报税额不一致的情况，是因为我国个税计税方式发生了改变，从2019年起，个人所得税采用每月预缴预扣、次年综合汇算的计算方法，也就是说纳税人平时在发放工资时所扣的个人所得税属于预缴税费，这并不代表实际应纳税额。
如果年度综合汇算应纳税额小于预缴税费，那么纳税人就可以申请退税，若年度综合汇算应纳税额高于预缴税费，纳税人就可能需要补交税费。
