西红柿没有根,而是根系。西红柿的根系类型为直根系,但由于侧根比较发达,常表现为直根系与须根系结合的形态。西红柿的根系根据其粗细可分为粗根和细根。粗根位于植株的根部,一般呈淡黄色或灰白色,粗细不一,根系粗壮程度与品种和栽培环境条件有关。细根位于粗根的外面,呈白色,细长而柔软,是吸收水分和养分的器官。西红柿的根系具有很强的吸收能力,能从土壤中吸收水分和养分,并将其输送到植株的各个器官。
西红柿为深根性作物,根系由主根和侧根构成,起固定植株和供给地上部水分和营养的作用。 番茄根系发达,分布广而深,且根的再生能力强,具有半耐旱作物的特征。 盛果期主根入土达150厘米以上, 育苗移栽时,主根被切断,易产生大量侧根,并横向发展,大部分根群分布在30~50厘米的土层中。