1. 按内容分类
GIS 按内容可分为专题地理信息系统、区域 地理信息系统 和 地理信息系统 工 具 三
( 1) 专题地理信息系统: 是以某一专业、任务或现象为主要内容的 GIS，为特定的专门目的服务，如森林动态监测信息系统、农作物估产信息系统、水土流失信息系统和土地管理信息系统等。
( 2) 区域地理信息系统: 主要以区域综合研究和全面信息服务为目标。区域可以是行政区，如国家级、省级、市级和县级等区域信息系统; 也可以是自然区域，如黄土高原区、黄淮海平原区和黄河流域等区域信息系统; 还可以是经济区域，如京津唐区和沪宁杭区等区域信息系统。
( 3) 地理信息系统工具: 是一组包括 GIS 基本功能的软件包。一般包括图形图像数字化、存储管理、查询检索、分析运算和多种输出等功能，GIS 工具软件适合用于建立专题或区域性实用 GIS 的支撑软件，也可作教学软件，如 Arc/Info，MapGIS 和 Citystar 等均属此类。
2. 按用途分类
GIS 按用途的不同可分为多种地理信息系统，如自然资源查询信息系统、规划与评价信息系统和土地管理信息系统。
除上述分类之外，GIS 还可以按照系统功能、数据结构、用户类型、数据容量等
