答： 1、 基因来源不同
转基因黄豆是通过人工技术将外源基因导入到黄豆基因组中，而非转基因黄豆则是无论是自然界还是人工选择培育出来的有机豆种。
2、种植技术不同
（1） 非转基因大豆是经过自然播种、种植生长出来的，属于纯天然产物，整个过程中没有经过任何人工干预，来改变大豆的特性。
（2） 转基因大豆，则是使用了现代生物种植技术，在大豆中转入了抗虫、抗药等基因，来获得表达相应基因的品种。
3、品质不同
一些研究表明，转基因黄豆可能因为过度依赖外源基因而导致品质降低，比如对味道和香气的影响等。而非转基因黄豆则在这方面相对稳定。
4、外观形态不同
转基因大豆的外观形状较规则，多为正圆形，因为成熟较快的原因，颜色较均匀，多为淡黄色，个头要更大一些，豆脐部位不太明显，外观较整洁，少有虫蛀现象。和转基因大豆相比，非转基因大豆形状多为椭圆形，颜色也要更深。非转基因大豆成熟过程更长。颜色不像转基因大豆那么均匀，豆脐部位也比较明显。
5、遗传特征不同
转基因黄豆的基因组会发生改变，以增强黄豆的某些遗传特征。而非转基因黄豆则没有经过相应的遗传改造。
6、安全性不同
转基因大豆是否有潜在的健康安全问题，目前并没有特别统一的回答，人们还是更放心非转基因大豆。
