北疆地区的蒙古族是准噶尔部后代。
准噶尔汗国是准噶尔部（卫拉特地区的一支）的首领噶尔丹于1676年打败卫拉特盟主鄂齐尔图汗之后，把松散的联盟体制步步改变为集权的政权体制后建立的君主制国家。
噶尔丹通过把准噶尔首领的台吉地位上升为汗王地位，在1678年正式建立了一个汗国。因1635年卫拉特盟主固始汗遣使归顺后金，且1646年卫拉特各部首领联名归顺清朝，所以噶尔丹改变了卫拉特与清朝的主从关系，标志着卫拉特蒙古的重新独立。
1670年，准噶尔首领巴图尔珲台吉的儿子僧格被杀后，他的异母弟噶尔丹夺得了准噶尔部的台吉位（低于汗位）。1676年噶尔丹打败卫拉特盟主鄂齐尔图汗，把松散的联盟步步改变为垄断权力的汗国。1678年，噶尔丹出兵南疆，占领叶尔羌汗国。1688年，噶尔丹突然率兵越过杭爱山，大举进攻土谢图汗，迫使喀尔喀蒙古诸部南迁。1690年6月，噶尔丹又向漠北喀尔喀蒙古进攻，康熙帝组织左右两路大军亲征，噶尔丹溃逃。
噶尔丹败亡后，他的侄子策妄阿拉布坦继任准噶尔部台吉，准噶尔部又逐渐强大起来，与清朝再次发生冲突。1716年，准噶尔部出兵西藏，占领拉萨。1718年，清朝由青海出兵入藏，全军覆没。1720年，清朝第二次出兵，赶走准噶尔军。1755年，乾隆帝趁准噶尔内乱之机出兵进占伊犁、击溃达瓦齐军。1757年，清军平定阿睦尔撒纳的叛乱，完全控制卫拉特区域，准噶尔汗国灭亡。
蒙古族。
准噶尔是厄拉特蒙古的一支部落。准噶尔是和明朝对峙的瓦剌部，后来瓦剌部在崛起的蒙古鞑靼部打击下向西迁移并发生分裂，在历史上又被称为卫拉特部，包括准噶尔部、和硕特部、土尔扈特部和杜尔伯特部四部，也称为漠西卫拉特。所辖地区北至额尔齐斯河、鄂毕河、叶尼塞河上游地区，南至天山，东到阿尔泰山和蒙古杭爱山分界线，西包巴尔喀什湖地区。
