叛乱的开端就是一场灭绝人性的屠杀，叛民血洗了一个小村庄，将整个村的人全都杀光。
同治年间西北叛乱从1862年开始，是发生在陕甘两地的回民的叛乱。 在当时很多回民在别有用心的穆斯林领袖的带领下，希望趁着清朝末年，时势动荡的时候在中国建立起一个政教合一的国家。
叛民骁勇善战，大规模的聚集起来，短短一两年的时间里陕西地区就有几百万的汉民遭到屠杀。
同治回乱自1862年起直至1873年结束，持续10余年后才被清廷镇压。
战争由陕甘回民和哲合忍耶苏菲门宦在圣山砍竹事件后的武装暴乱开始，主要表现为回民与汉民的互相攻击。
根本原因是清廷的压迫
清朝同治年间，西北的官僚对西北民众施以沉重的田赋附加。清代的田赋附加，起于康熙六十一年，当时每正赋银一两之上加征“耗羡”二钱，以为政府办公费和官吏津贴之用。
清政府实收的田赋增加到了正规田赋的160%。陕西田亩，除了民田之外，还有元明时期留下来的“屯卫田”、“更名田”，都是官产，农民种官田者，必须缴纳 “本色”、“样粮”、“土粮”、“余粮”等，仓吏收租时，巧立名目，把十多个项目摊入租赋之中。在同治年间以前，以永丰、敬录两仓道来说，每年政府收入的征粮不过十八万石，而官吏对纳粮百姓的强征量就有二十几万之多。贫苦农民，无论回汉，已经无法生存，还要忍受附加之外的傜役。西北地区，清代一直战事不断。
清政府对外割地赔款，对内需要筹措大量军费镇压各地农民起事，因而对农民的苛捐杂税更为加重。陕西地区，在回民暴动之前就爆发过两次农民运动。
