博斯腾湖大湖区入湖总水量14.23×108立方米/年,其中河流水量5.24~35.46×108立方米/年(年均13.49×108立方米/年),约占总水量的94.80%;
降水补给0.19~1.59×108立方米/年(年均0.74×108立方米/年),约占5.20%;
出湖总水量14.58×108立方米/年,其中大湖输出水量1.37~13.61×108立方米/年(年均5.88×108立方米/年),占总水量的39.58%;
湖面蒸发量5.94~11.66×108立方米/年(年均8.70×108立方米/年),约占60.42%;
湖区蓄水量增量-8.97~7.74×108立方米/年(年均-0.74×108立方米/年),残差水量(农渠排水和地下水)-5.62~16.96×108立方米/年(年均0.39×108立方米/年),仅占入湖河流水量的2.89%。
博斯腾湖介于东经86°40′~87°25′,北纬41°56′~42°14′之间,东西长55公里,南北宽25公里,水域总面积800多平方公里(2014年),湖面海拔1048米,平均深度9米,最深处17米。湖区深居欧亚腹地,光照充足,热量丰沛,雨量稀少,属典型的温带大陆性气候