在日留学生帝国大学工科硕士的真实经历回答。
前面的回答都在程序上说的比较具体了。
我就根据我留学的经历和身边朋友的经历说几个比较需要注意的地方。
1、如果你想来语言学校，一般不需要找中介。很多大的语言学校会在国内设招生点，有专门的老师负责指导你办理手续。我当初咨询过一个中介，他张口就要我2万元的申请费。其实就是利用了信息不对称来谋求利益的，自己完全可以DIY。
2、如果你想读硕士的话，有两条途径。读研究生或直接考硕士。
研究生并不是我们说的硕士，在日本是指非正式的预科生，它的好处是可以帮你过度熟悉来日本的生活。一开始来日本很多地方还不熟悉就要匆匆备考，想必压力会很大。这个时候做教授的研究生一是可以熟悉研究室的气氛，获取外部生获得不到的备考资源，二是可以和教授混个脸熟。
申请研究生的话，首先你的目标已经定到了日本的排名靠前的帝国大学了吧。各个地区分别有不同的大学，可以先想好你想去的地区再选择学校。东京、大阪、京都人气都比较高，竞争也比较激烈。地方大学，像九州大学，东北大学的实力也很强，由于地域原因，并不像上述的那么热门。
决定学校后，还要决定你想研究的领域，这个领域的哪个教授。与这个相关的信息就要到各个大学的官网上去查，可以了解到这个教授的研究方向，研究室成员，有没有收过留学生，氛围怎么样都可以看到。
根据我的经历，申请研究生是一件很玄学的事情，你给教授发想要申请他的研究生的邮件后，有可能石沉大海，有可能被婉拒，婉拒的理由有要退休了呀，要转职去国外了呀等等。而我现在所在的研究室，我曾经问过我的老师要不要收研究生，他说今年研究室的地方不够就不收了！等等诸如此类原因，所以申请研究生的时候也许会遇到很多意想不到的挫折，不要放弃～
为了防止这种风险，建议你还同时可以准备硕士入学考试（跳过研究生这一步直接考）。个人的经历就是直接考上的，而和我一起参加考试的两个研究生都没有考上。因为你参加入学考试过了的话，教授就没有理由拒绝你（当然考之前要跟教授打招呼说我要考你的院生，京都大学甚至都不需要打招呼），大部分大学会公开他们近几年的考试题，有助于帮你备考。
回答就先到这里啦，有什么其他的问题可以给我留言，祝你顺利！
以上
